中国历史上瘟疫大爆发最长的一次发生在东汉末年，这是中国历史上瘟疫爆发最长的一次，这次瘟疫一直持续到三国时期，甚至到了晋朝的建立。
东汉的瘟疫起源于汉灵帝的时候，当时汉朝的人口大约有5600万人，但是到了西晋建立的时候，当时整个人口只有1600万人，直接就损失了4000万人口，可以说是损失2/3，其实三国的时候，赤壁之战的时候，之所以曹操打了败仗的原因，最重要的原因就是由于军队的长期的运输，导致到了东吴这个地方，士兵环境不能适应，还有一个原因就是瘟疫传播速度太快，许多士兵来到了东吴，已经感染了这种瘟疫。
所以三国时期只能形成魏蜀吴三国鼎立的局面，因为古代君主也是要保住自己本国的人，才能有精力去攻打其他国家，但是面对这种大灾大难的情况下，我们古人也是非常聪明的，这时就出现了张仲景这位名医，可以说是非常了不起一位医生；如果东汉时期没有这位明医不知道要死多少人。
所以他在这次治疗瘟疫的期间也写了一本书《伤寒杂病论》，这本书对于我们今天也是非常有借鉴意义的。
但是古代的瘟疫传播速度并没有我们今天那么快，因为我国古代有着严格的户籍管理制度在里面，一旦发现了瘟疫或者天灾等自然现象，马上就会采取隔离、封村、封县这样的情况。
有些网友就问，如果新冠肺炎发生在古代，是不是古代人就会全部死亡，其实是不会的，因为古代是相对于封闭，而且交通又不怎么方便，所以只需要采取相应的隔离措施和防护措施也是没有多大问题的。
而且古代如果发生了瘟疫，死在瘟疫中的人都是采取火化的措施，所以真的古代发生瘟疫也是不会导致人类的灭亡。
中国古代瘟疫最严重的就是发生在清朝，因为清朝中国封建社会经济也是相应达到了顶峰，而且资本主义经济也萌芽，所以户籍管理也不那么严，所以清朝瘟疫占据了中国历史上的1/3。
综上所述，中国历史瘟疫持续时间最长的是在东汉末年。