第一集和故事内容完全没有关系。 故事是这样的： 凉宫春日拥有神的能力，但自己却不知道，她所有的想法和期望都会变成现实，所以世界在她的常识和愿望中不断陷入危机。 与此同时，长门有希（外星人）古泉一树（超能力者）朝比奈实玖瑠（未来人）三方势力都在关注凉宫的情绪变化，而能够控制和稳定凉宫情绪的唯一的人就是主人公阿虚（普通人）。 凉宫在小时候的一次棒球比赛之后发现了自己渺小，于是希望这个世界更加不同寻常，国中时期做出过各种怪异的举动。 高中之后组建了sos团，意在找到外星人，未来人，超能力人，并与他们玩，没想到这三种人就在她身边关注着她，唯一不知道真相的就是凉宫自己。